More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3656 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3656  putative hydrolase  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  20.76 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  31.84 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  28.57 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  29.92 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  22.75 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5020  alpha/beta hydrolase  27.43 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.69 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  24.15 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.81 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  27.03 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 329 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  20.68 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.95 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.95 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  25.79 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.95 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.5 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  31.11 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 391 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 304 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  52.73 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3114  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5253  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  20.68 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  19.65 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  33.54 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 308 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  20.69 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  20.69 
 
 		 294 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>