More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5253 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3114  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5253  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5020  alpha/beta hydrolase  98.03 
 
 		 203 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0400  Alpha/beta hydrolase  90.64 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38590  hypothetical protein  55.33 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  45.41 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3518  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0367  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0376  alpha/beta hydrolase fold protein  43.94 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.36 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.18 
 
 		 294 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 314 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  40.51 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  45.9 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  33.93 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.36 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.89 
 
 		 370 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 286 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  24.3 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 284 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 288 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 308 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.77 
 
 		 284 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  23.88 
 
 		 294 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  37.5 
 
 		 274 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 261 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 284 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.05 
 
 		 283 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 266 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.05 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  23.88 
 
 		 294 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.05 
 
 		 305 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.8 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.05 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 288 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  26.64 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  23.88 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  23.88 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  23.88 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  33.33 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  23.88 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  23.88 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.57 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.58 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  38.03 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.42 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  23.88 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  26.17 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  28.02 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  22.84 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  37.35 
 
 		 322 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  19.62 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  35.29 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.29 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 		 290 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  20.58 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.22 
 
 		 265 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 278 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.11 
 
 		 425 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  20.58 
 
 		 259 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.28 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>