More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0348 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  100 
 
 
205 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0367  alpha/beta hydrolase fold  92 
 
 
207 aa  356  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0376  alpha/beta hydrolase fold protein  90.95 
 
 
207 aa  350  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3518  alpha/beta hydrolase fold  67.34 
 
 
200 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0400  Alpha/beta hydrolase  43.88 
 
 
203 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5020  alpha/beta hydrolase  44.9 
 
 
203 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.737284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3114  alpha/beta hydrolase fold  45.41 
 
 
203 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5253  alpha/beta hydrolase fold  45.41 
 
 
203 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38590  hypothetical protein  49.66 
 
 
154 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.08 
 
 
268 aa  87.8  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  34.6 
 
 
251 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 
393 aa  71.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.18 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  30.83 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 
326 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 
393 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
287 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
346 aa  64.7  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
287 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.34 
 
 
260 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
289 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
316 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.22 
 
 
295 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.58 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
260 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
269 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 
260 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
391 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
275 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
260 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 
288 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.03 
 
 
272 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.45 
 
 
425 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
291 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
291 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
291 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
273 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 
277 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  20.72 
 
 
290 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
323 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
271 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
288 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.15 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.86 
 
 
370 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.86 
 
 
285 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 
240 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
265 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 
263 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
272 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
290 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
309 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.17 
 
 
369 aa  58.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  25.51 
 
 
312 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  27.46 
 
 
285 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  27.46 
 
 
285 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  21.46 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  28.26 
 
 
255 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
312 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
279 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
260 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.71 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
284 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
275 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
302 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>