270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5020 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5020  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
203 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.737284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3114  alpha/beta hydrolase fold  98.03 
 
 
203 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5253  alpha/beta hydrolase fold  98.03 
 
 
203 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0400  Alpha/beta hydrolase  90.15 
 
 
203 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38590  hypothetical protein  54.67 
 
 
154 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3518  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
200 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.9 
 
 
205 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0367  alpha/beta hydrolase fold  44.39 
 
 
207 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0376  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 
207 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.15 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
277 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.18 
 
 
294 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
431 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
301 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
287 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 
263 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.8 
 
 
283 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  40.51 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  45.9 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 
314 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.39 
 
 
305 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
273 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.47 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  37.5 
 
 
274 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.97 
 
 
283 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  43.55 
 
 
285 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.56 
 
 
285 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  25.51 
 
 
334 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  43.55 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3656  putative hydrolase  27.43 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
296 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
278 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  46.67 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  26.64 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  38.03 
 
 
273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  37.35 
 
 
322 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
286 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  28.02 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.42 
 
 
370 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
286 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
290 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  41.94 
 
 
285 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.62 
 
 
295 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  44.9 
 
 
289 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  28.64 
 
 
260 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  23.83 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
287 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 
273 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
288 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
287 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  45.61 
 
 
273 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.43 
 
 
261 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 
284 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  21.83 
 
 
257 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  32.29 
 
 
261 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  23.18 
 
 
286 aa  48.5  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
256 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
269 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
284 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
284 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
276 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.34 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  28.05 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
288 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 
308 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
299 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 
277 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3113  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
311 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  40.32 
 
 
273 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  21.28 
 
 
311 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 
256 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 
294 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 
256 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  23.13 
 
 
294 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  40.85 
 
 
393 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
330 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
272 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
289 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  43.86 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
277 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  43.86 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  43.86 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>