More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1886 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  50.2 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  45.17 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  43.25 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  37.25 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  37.75 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  32.65 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.59 
 
 		 571 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.44 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.84 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  37.5 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.66 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31 
 
 		 370 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10991  Alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.312189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  36.81 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.05 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.91 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.09 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.74 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.89 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.15 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.84 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.57 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11771  Alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.08 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.38 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.52 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.95 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  29.57 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>