More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2103 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
296 aa  591  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  98.99 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  72.2 
 
 
300 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  57.75 
 
 
291 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  55.44 
 
 
293 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  56.16 
 
 
295 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  49.63 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 
284 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.78 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.78 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.47 
 
 
369 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.84 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.3 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.2 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  24.91 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.2 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
349 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.76 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
421 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.97 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  39.81 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.01 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.35 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.17 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.34 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.64 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  34 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.68 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.16 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  37.04 
 
 
494 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  28.34 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  32.64 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
315 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
248 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
274 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
269 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>