More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1863 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  70 
 
 
291 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  58.24 
 
 
300 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  55.44 
 
 
296 aa  285  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  55.44 
 
 
296 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  55.51 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 
295 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  34.97 
 
 
290 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  33.89 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  29.89 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  33.07 
 
 
291 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.41 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.52 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.24 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.8 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.43 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.17 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.54 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.09 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.52 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.13 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  37.12 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.69 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.61 
 
 
276 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.97 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.62 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.25 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
330 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.8 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  30.3 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  30.3 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.78 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  30.3 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  30.3 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  42.57 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.92 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
340 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>