254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2492 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  56.51 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  56.16 
 
 
296 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 
293 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  51.18 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  47.01 
 
 
313 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  39.59 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  39.69 
 
 
298 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
284 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.81 
 
 
571 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
278 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.46 
 
 
367 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  23.4 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  29.08 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
353 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
352 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
278 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
284 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
294 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
261 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  30.08 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.14 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.84 
 
 
246 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  23.34 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.1 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  21.82 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  26.3 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.92 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  25.27 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  27.11 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
262 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  29.91 
 
 
364 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
302 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  21.82 
 
 
271 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.1 
 
 
293 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
315 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  30.22 
 
 
298 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
309 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  29.91 
 
 
360 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  29.91 
 
 
360 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  29.91 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>