13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1571 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  440  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48041  normal  0.0731359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1850  hypothetical protein  97.37 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22546  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1668  hypothetical protein  93.09 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0390107  normal  0.64183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  74.01 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4102  hypothetical protein  80.09 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  75.44 
 
 		 285 aa  314  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  39.73 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  37.95 
 
 		 300 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 327 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>