67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3768 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  88.33 
 
 		 317 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  77.85 
 
 		 317 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  72.93 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  53.29 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  53.87 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  53.82 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  54.08 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 329 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  48.66 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  48.32 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  48.32 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  46.33 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.63 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.65 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  23.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.34 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  25.85 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  25.16 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  26.6 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  25.56 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  23.47 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  23.4 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  22.64 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  26.77 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  22.16 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  22.79 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  22.02 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  23.83 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  25.12 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  23.1 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 366 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 275 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  26.01 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>