53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4635 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
343 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  96.48 
 
 
342 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  93.27 
 
 
342 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  66.03 
 
 
342 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  62.65 
 
 
342 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
322 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  51.74 
 
 
327 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  51.94 
 
 
329 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  48.16 
 
 
327 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  48.51 
 
 
317 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  50.5 
 
 
316 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  41.02 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 
289 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 
311 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
320 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
289 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 
340 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.55 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  25.79 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
300 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  26.92 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 
290 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  25.48 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.46 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
248 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.58 
 
 
297 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.91 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.66 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
298 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
332 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 
350 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.29 
 
 
372 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
279 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  23.15 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 
292 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>