73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1697 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  77.85 
 
 		 317 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  78.03 
 
 		 317 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  68.89 
 
 		 316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  56.08 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  55.29 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  51.25 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  53.54 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  51.13 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 		 343 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  47.65 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.25 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  22.83 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  27.02 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  24.65 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  25.13 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.44 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  26.58 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.33 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.66 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.81 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.81 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.34 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.46 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>