61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5702 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
342 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  68.34 
 
 
342 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  63 
 
 
342 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  62.65 
 
 
343 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  62.39 
 
 
342 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
331 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
329 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
322 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 
317 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  46.33 
 
 
317 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  46.46 
 
 
317 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  47.81 
 
 
316 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 
327 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  45.36 
 
 
327 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 
321 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
289 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
293 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
289 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
311 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
327 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
320 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
299 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  27.9 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.84 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  26.94 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  23.56 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  26.72 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  30.24 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
275 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
274 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.91 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.22 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
280 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.95 
 
 
297 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  24.02 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
324 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.14 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
346 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  24.87 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
290 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
309 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  26.18 
 
 
303 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>