96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4831 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  79.48 
 
 
420 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  79.74 
 
 
385 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  76.88 
 
 
390 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  74.09 
 
 
390 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  73.68 
 
 
386 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  63.64 
 
 
385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  58.07 
 
 
386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  56.1 
 
 
385 aa  428  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  50.79 
 
 
400 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  50.79 
 
 
400 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  50.53 
 
 
381 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  44.74 
 
 
387 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  37.4 
 
 
388 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  36.03 
 
 
383 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  31.47 
 
 
403 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  28.83 
 
 
401 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  31.28 
 
 
406 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.65 
 
 
448 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  26.5 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  29.22 
 
 
417 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.15 
 
 
463 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.4 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.83 
 
 
434 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.59 
 
 
402 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.03 
 
 
357 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  32.69 
 
 
399 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.28 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.13 
 
 
420 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.11 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  31.1 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.33 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.01 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  31.9 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  31.9 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  26.43 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  25.09 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  31.41 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  24.35 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  22.08 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  21.98 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  25.9 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  21.25 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  20.96 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  22.08 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.53 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  23.79 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  26.89 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
626 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.57 
 
 
626 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.94 
 
 
575 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  34.4 
 
 
316 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.6 
 
 
626 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.81 
 
 
646 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  26.01 
 
 
498 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.18 
 
 
607 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  28.57 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.99 
 
 
632 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  26.67 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.56 
 
 
641 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  28.93 
 
 
256 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.23 
 
 
824 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.18 
 
 
656 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1546  hypothetical protein  23.58 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.84 
 
 
924 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  30.06 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0720  hypothetical protein  22.86 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.65 
 
 
612 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.77 
 
 
630 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.42 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.32 
 
 
596 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.89 
 
 
642 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.76 
 
 
636 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.66 
 
 
652 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  22.54 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.39 
 
 
678 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  26.03 
 
 
251 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.17 
 
 
741 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  24.69 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  26.09 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2341  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.57 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161596  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  27.46 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  25.9 
 
 
655 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.51 
 
 
594 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.83 
 
 
677 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  21.76 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
668 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.58 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.31 
 
 
685 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.04 
 
 
695 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.4 
 
 
621 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  34.13 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  26.71 
 
 
532 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>