59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1853 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  849    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  46.08 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  43.01 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  43.5 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  39.51 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  40.1 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  39.23 
 
 		 463 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  39.16 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  36.32 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  35.01 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  35.01 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  32.72 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  36.44 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  32.12 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  31.77 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  32.1 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  29.75 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  30.4 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  30.58 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  31.32 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  28.43 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  29.22 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  29 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.15 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.11 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  29.02 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  25.07 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  25.07 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  27.5 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.77 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 		 373 aa  113  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  28.11 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  28.11 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.91 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.04 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  26.7 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.07 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  26.98 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  27.75 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  32.85 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  24.43 
 
 		 378 aa  87.4  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  27.54 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.69 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  29.75 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  22.85 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.27 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  38.3 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  24.9 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  25.78 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0325  hypothetical protein  27.1 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  36.47 
 
 		 326 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  35.23 
 
 		 259 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  41.27 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.75 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.55 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.45 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  29.5 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  37.84 
 
 		 259 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  37.84 
 
 		 259 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>