50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2308 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  798    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  51.41 
 
 		 399 aa  362  9e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  48.85 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  44.14 
 
 		 418 aa  312  6.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  38.27 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  31.93 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  38.85 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  37.12 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  33.59 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  33.91 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  33.08 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.35 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  33.06 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  31.83 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  35.48 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  26.35 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  26.32 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  33.93 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  33.89 
 
 		 420 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.06 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.3 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  31.86 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  28.11 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  29.87 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  31.3 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  32.69 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  29.32 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  26.24 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  31.39 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  25.63 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.79 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  23.47 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  23.72 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.05 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.8 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  27.45 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.69 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  27.45 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  25.63 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  26.19 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.12 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.14 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.65 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  40.7 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  24.49 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  30.73 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 		 697 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>