54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1988 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  722    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  56.07 
 
 		 615 aa  417  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  42.17 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.33 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  30.52 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1399  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.79 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0801845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  25.23 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.86 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  23.31 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  21.6 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  23.41 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  22.9 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  27.05 
 
 		 301 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  25.51 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  19.11 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  24.14 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.56 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.88 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.16 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  27.05 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.12 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  22.78 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  34.86 
 
 		 280 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  30.3 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  26.03 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  22.75 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  31.93 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  27.34 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.14 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  25.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  22 
 
 		 657 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  28.32 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  27.37 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  23.15 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  25.15 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  19.15 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  25.37 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  23.46 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29 
 
 		 568 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  23.6 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  25.19 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>