42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0979 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 325 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  61.93 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  62.04 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  62.08 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  62.38 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  62.5 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  62.38 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  64.88 
 
 		 303 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  61.89 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  62.3 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  62.62 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  63.85 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  61 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  62.54 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  61.84 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  57.19 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  47.78 
 
 		 274 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  41.1 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  29.2 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.56 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.26 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  27.3 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  29.1 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  28.42 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  29.74 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  29.09 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.16 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  30.06 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  34.78 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  31.54 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  29.91 
 
 		 354 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  26.51 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>