71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1594 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  95.03 
 
 		 342 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 342 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  94.55 
 
 		 330 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  87.72 
 
 		 342 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  74.53 
 
 		 329 aa  487  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  73.09 
 
 		 329 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  72.26 
 
 		 330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  67.19 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  65.22 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  65.06 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  27.46 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  27.82 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  27.05 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  28.28 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.67 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  25.85 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1152 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.87 
 
 		 1152 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  26.79 
 
 		 473 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  25.88 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  21.67 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 264 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.66 
 
 		 1132 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  33.67 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  31.87 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 226 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  24.72 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>