33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3222 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  98.79 
 
 
331 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  96.98 
 
 
331 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
331 aa  683    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  97.28 
 
 
331 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  83.94 
 
 
325 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  82.82 
 
 
333 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  84.01 
 
 
328 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  82.21 
 
 
333 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  81.9 
 
 
333 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  67.94 
 
 
302 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  65.59 
 
 
303 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  65.08 
 
 
302 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  61.14 
 
 
325 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  63.52 
 
 
308 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 
314 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 
313 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
274 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  40.59 
 
 
334 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  25.58 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.48 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  26.26 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.39 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  25.34 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  27.3 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  26.76 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  23.97 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  23.46 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>