37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3372 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 314 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  75.65 
 
 		 313 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  73.67 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  68.75 
 
 		 302 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  64.84 
 
 		 328 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  64.19 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  64.52 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  64.19 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  63.26 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  66.01 
 
 		 303 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  61.99 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  62.94 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  62.38 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  63.26 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  61.51 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  61.84 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 		 274 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  39.14 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  29.15 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  28.87 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.42 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  28.33 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.99 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.93 
 
 		 342 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  27.3 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  28.04 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  27.01 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.84 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.08 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>