59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2293 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
330 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  85.45 
 
 
329 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  73.27 
 
 
329 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  72.33 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  73.27 
 
 
342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  72.26 
 
 
342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  73.27 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  66.26 
 
 
329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  67.72 
 
 
336 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  66.14 
 
 
336 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  26.64 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  27.47 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  27.5 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  25.63 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.95 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  26.15 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
268 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.71 
 
 
1132 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
258 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  33.09 
 
 
1152 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 
1152 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  28.4 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  23.75 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
256 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  39.77 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.07 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>