33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1008 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  71.53 
 
 		 303 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  67.62 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  70.96 
 
 		 328 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  67.94 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  69.26 
 
 		 325 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  68.63 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  69.97 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  69.97 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  68.3 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  69.31 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  64.21 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  63.85 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  62.91 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  61.51 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  60.13 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  45.8 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  40.99 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.32 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  29.26 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  27.51 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  30 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 		 342 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  25.09 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.37 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  26.94 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>