36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1043 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 333 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  98.5 
 
 		 333 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  96.1 
 
 		 333 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  90.48 
 
 		 328 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  83.02 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  81.6 
 
 		 331 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  84.03 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  80.67 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  83.07 
 
 		 331 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  68.63 
 
 		 302 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  67.99 
 
 		 303 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  66.99 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  64.44 
 
 		 313 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  69.97 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  62.08 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  64.19 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  42.47 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  27.33 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  29.68 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  29.2 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.76 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.4 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  26.69 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.43 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.26 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  25.36 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.69 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 301 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  32.18 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>