202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1479 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 309 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  31.9 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  32.76 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.9 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  29.43 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  29.55 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  29.04 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  28.06 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.57 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  25.75 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  25.33 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  25.85 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.36 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  24.58 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  36.36 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  43.33 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 374 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 347 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  25.08 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  22.33 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  26.94 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.9 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.36 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.83 
 
 		 2762 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  26.03 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  32.43 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.28 
 
 		 1150 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  25.21 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  24.59 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  23.76 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  26.24 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  26.24 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  26.24 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  26.24 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  26.72 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  26.24 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  26.24 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.22 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  36.89 
 
 		 501 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  21.29 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  20.08 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.42 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19134  predicted protein  32.56 
 
 		 417 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>