More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4137 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
268 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  48.83 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 
297 aa  185  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
267 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
283 aa  175  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
276 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
260 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 
265 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
269 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
264 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
263 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
296 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
295 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  29.92 
 
 
262 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
293 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  26.38 
 
 
386 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  29.41 
 
 
264 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  29.57 
 
 
278 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.19 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  29.1 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  26.34 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  38.89 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  26.27 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  23.48 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  28.19 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  20 
 
 
222 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
317 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  22.22 
 
 
266 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  30.3 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  22.81 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  25.55 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
262 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  25.83 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  32.08 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  28.99 
 
 
395 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.09 
 
 
273 aa  55.8  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  29.55 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  21.54 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  27.97 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  28.79 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  28.57 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  24 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
340 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5615  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.04 
 
 
330 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.62 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
334 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  23.66 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.5 
 
 
234 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
273 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
274 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  28.35 
 
 
338 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
289 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
302 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  26.51 
 
 
280 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  33 
 
 
408 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  39.81 
 
 
274 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
290 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  39.81 
 
 
274 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
289 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0701  hypothetical protein  35.16 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000328167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>