44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2043 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 347 aa  722    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1737  alpha/beta hydrolase fold  56.33 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  38.61 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0951  alpha/beta hydrolase fold  77.89 
 
 		 95 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1921  Alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  hitchhiker  0.00212395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1709  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000106248  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2172  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1533  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  27.64 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  21.68 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34884  predicted protein  20.58 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.435198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33 
 
 		 1152 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  26.26 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1152 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  27.14 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.46 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  26.26 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.21 
 
 		 1132 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.55 
 
 		 518 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 239 aa  43.5  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 281 aa  43.5  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.11 
 
 		 596 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 280 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  25.4 
 
 		 2648 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  32.17 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.42 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.04 
 
 		 272 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.58 
 
 		 300 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>