More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6377 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  100 
 
 
300 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  93 
 
 
300 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  67.45 
 
 
307 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  67.57 
 
 
316 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  63.64 
 
 
299 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  65.1 
 
 
297 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  60 
 
 
300 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  62.76 
 
 
313 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  53.02 
 
 
306 aa  322  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  50.33 
 
 
319 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  50.18 
 
 
296 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  38.85 
 
 
295 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  39.86 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  35.93 
 
 
298 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  34.58 
 
 
298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  37.13 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  35.69 
 
 
303 aa  178  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  36 
 
 
287 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  36.88 
 
 
296 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  35.11 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  35.15 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  36.65 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  35.14 
 
 
316 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  34.2 
 
 
286 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  30.63 
 
 
304 aa  155  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  30.07 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  29.25 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  31.38 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  26.99 
 
 
339 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.78 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  31.53 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  28.62 
 
 
303 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  27.03 
 
 
301 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  27.7 
 
 
303 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  27.08 
 
 
304 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  24.65 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.45 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  29.75 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  28.68 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.55 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  23.21 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  22.85 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  25.38 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  23.47 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  30.23 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.34 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.38 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.01 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  21.3 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.88 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
364 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.08 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.98 
 
 
397 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
261 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  24.07 
 
 
264 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  23.64 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  22.92 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.1 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  23.75 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  32.94 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.83 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  22.95 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  21.29 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>