41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0864 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  100 
 
 
314 aa  632  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  44.6 
 
 
337 aa  258  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0269  hypothetical protein  29.39 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0286  hypothetical protein  35.38 
 
 
318 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2835  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0510204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  26.26 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.42 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.42 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  22.42 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  22.42 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  22.42 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.42 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  21.97 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  21.97 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  21.97 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  25.38 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.1 
 
 
424 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  28.12 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  31.75 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  21.09 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  22.75 
 
 
277 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  21.13 
 
 
253 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  27.51 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  23.79 
 
 
294 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  25 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  28.28 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  26.46 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  28.68 
 
 
498 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  22.05 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.11 
 
 
645 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  22.26 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  26.8 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  27.33 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.27 
 
 
296 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  23.4 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  27.43 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  21.21 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>