33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0286 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0286  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0269  hypothetical protein  46.62 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2835  hypothetical protein  42.13 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0510204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  30.65 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  35.38 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.54 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  31.25 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.5 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  29.17 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  29.17 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  26.94 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  29.17 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  29.17 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  29.17 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  29.47 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.99 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  23.9 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  23.9 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  23.9 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  26.36 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1326  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.15 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  26.61 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  23.33 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  40.43 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0576  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.77 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  26.19 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  40.43 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.82 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>