39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0269 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  617  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0286  hypothetical protein  47.46 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2835  hypothetical protein  36.46 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0510204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  31.92 
 
 		 337 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  29.39 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.59 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28.64 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  26.1 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  23.24 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  27.14 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  24.83 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  24.83 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  24.83 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  35.21 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  24.88 
 
 		 266 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  24.83 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  25.96 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  26.44 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  22.71 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.78 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  23.62 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  23.62 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  26.34 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  23.62 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  23.62 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  23.62 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  23.5 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  23.62 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  23.62 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  27.44 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  25.26 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.71 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  24.53 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  26.85 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>