69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1764 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1764  putative hydrolase  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35222  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.46 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.16 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  29.44 
 
 
307 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  30.33 
 
 
322 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.8 
 
 
331 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  27.67 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  33.96 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  25.31 
 
 
411 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  24.87 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  23.69 
 
 
339 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  28.1 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  27.27 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  27.03 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  26.83 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  27.03 
 
 
355 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  26.4 
 
 
768 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  25.82 
 
 
324 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  27.98 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.92 
 
 
319 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  26.85 
 
 
309 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  23.87 
 
 
391 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07816  Putative sterigmatocystin biosynthesis lipase/esterase stcI [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00675]  24.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.324256  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  24.68 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.24 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.78 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.51 
 
 
588 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  24.68 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.82 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  24.3 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  26.54 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.69 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.34 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  27.37 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  27.4 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.27 
 
 
409 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  28.87 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.22 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  24.79 
 
 
691 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  24.9 
 
 
665 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.78 
 
 
641 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  29.05 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.94 
 
 
1094 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  21.26 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.53 
 
 
661 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  31.45 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.75 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  34.04 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00811  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.78 
 
 
641 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.34 
 
 
682 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.44 
 
 
644 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  22.6 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.73 
 
 
641 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  32.19 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.6 
 
 
800 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  29.15 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.74 
 
 
680 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.32 
 
 
668 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  35.29 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.83 
 
 
294 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.04 
 
 
308 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.78 
 
 
643 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  30.34 
 
 
303 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  27.81 
 
 
294 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.58 
 
 
689 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>