More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1347 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.44 
 
 
303 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.64 
 
 
300 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42 
 
 
309 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.14 
 
 
304 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.69 
 
 
302 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.85 
 
 
311 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.75 
 
 
314 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.63 
 
 
312 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.41 
 
 
296 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.72 
 
 
298 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.15 
 
 
347 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  46.37 
 
 
299 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.22 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  40.74 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.7 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.54 
 
 
297 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.37 
 
 
320 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.29 
 
 
318 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.93 
 
 
301 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  42.11 
 
 
561 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.02 
 
 
296 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  38.78 
 
 
318 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.41 
 
 
296 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.97 
 
 
354 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.92 
 
 
293 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.02 
 
 
296 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.96 
 
 
300 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.98 
 
 
316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.37 
 
 
320 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.4 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 
322 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  41.04 
 
 
320 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.79 
 
 
306 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.39 
 
 
320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.39 
 
 
320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.33 
 
 
298 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  41.3 
 
 
321 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  36 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.04 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.07 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  38.36 
 
 
317 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  39.67 
 
 
321 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.47 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.47 
 
 
298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.92 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.04 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  39.33 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  39.33 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  39.33 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  39.33 
 
 
321 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  39.33 
 
 
321 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  39.33 
 
 
321 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.82 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.2 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  38.59 
 
 
326 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.69 
 
 
297 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  38.91 
 
 
308 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.3 
 
 
303 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.49 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  43.95 
 
 
309 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.74 
 
 
320 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.74 
 
 
320 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04570  conserved hypothetical protein  39.68 
 
 
746 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  34.18 
 
 
297 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3232  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.67 
 
 
336 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.52 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  40.61 
 
 
335 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.52 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.52 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.87 
 
 
323 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  39.33 
 
 
321 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2666  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.03 
 
 
293 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.21 
 
 
323 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.12 
 
 
326 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  40.36 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.84 
 
 
300 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.6 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.23 
 
 
396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1377  esterase/lipase-like protein  33.46 
 
 
341 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.25 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.58 
 
 
372 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  41.8 
 
 
816 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.48 
 
 
303 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.39 
 
 
328 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  38.98 
 
 
303 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.74 
 
 
320 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.48 
 
 
303 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.41 
 
 
294 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.29 
 
 
303 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2588  putative esterase/lipase  36.97 
 
 
298 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.98 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.59 
 
 
303 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3228  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.9 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.24 
 
 
417 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1479  esterase/lipase/thioesterase  45.32 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.17 
 
 
303 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4007  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.81 
 
 
306 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12410  acetyl hydrolase mbtJ  40 
 
 
306 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.492248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>