More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0439 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  82.05 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  79.01 
 
 		 323 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  52.17 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  51.74 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.38 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  54.43 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.07 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  51.91 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  52.7 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  52.7 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.64 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  52.7 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  52.7 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.96 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  51.59 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.59 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  52.1 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  52.1 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  52.1 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.27 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  53.33 
 
 		 321 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.21 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.98 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.04 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.72 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.38 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.15 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  50 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.69 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.5 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.15 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.93 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.85 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.3 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04570  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 		 746 aa  186  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.53 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.37 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.76 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.36 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.72 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.83 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.22 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.08 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.4 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.21 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.7 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  43.56 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  40.29 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.11 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.72 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.01 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.45 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.65 
 
 		 287 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.01 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  43.19 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.91 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.81 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  39.84 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.4 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  36.81 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  40.35 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.09 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  37.88 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  45.98 
 
 		 816 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.09 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.19 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.19 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.19 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.32 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.51 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.08 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.43 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.79 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  35.84 
 
 		 561 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.06 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.79 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.21 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  35.87 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.65 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.9 
 
 		 369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0616  esterase, putative  33 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.31 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 816 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44 
 
 		 816 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 816 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.31 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0451  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.48 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.68 
 
 		 372 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.21 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.97 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.32 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0843  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.63 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 		 361 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>