More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0117 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
361 aa  723    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.21 
 
 
328 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3818  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.93 
 
 
328 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12410  acetyl hydrolase mbtJ  43.16 
 
 
306 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.492248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.64 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.47 
 
 
318 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.47 
 
 
318 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.47 
 
 
318 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.02 
 
 
317 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.96 
 
 
323 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  38.46 
 
 
318 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.6 
 
 
320 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.13 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  36.5 
 
 
335 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.35 
 
 
318 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.51 
 
 
316 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.57 
 
 
310 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  42.05 
 
 
315 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  42.05 
 
 
321 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  42.05 
 
 
321 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  42.05 
 
 
321 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.29 
 
 
306 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  42.05 
 
 
315 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  42.05 
 
 
315 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  42.05 
 
 
321 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.6 
 
 
320 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  39.77 
 
 
320 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.53 
 
 
320 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.53 
 
 
320 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.53 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.42 
 
 
396 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.47 
 
 
302 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.59 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 
309 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  41.51 
 
 
321 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.09 
 
 
301 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.39 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  40.93 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.55 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.91 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.26 
 
 
299 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.19 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.91 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.25 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 
311 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.6 
 
 
296 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.46 
 
 
296 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 
305 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.12 
 
 
335 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.08 
 
 
304 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.61 
 
 
296 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  34.92 
 
 
326 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.23 
 
 
319 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  36.89 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.6 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.82 
 
 
287 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.36 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2042  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.74 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.73 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.78 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.16 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.51 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.77 
 
 
277 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  31.62 
 
 
561 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  33.78 
 
 
297 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4675  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.04 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  33.88 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  29.08 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.79 
 
 
297 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4150  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.71 
 
 
350 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4225  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
350 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604288  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4381  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
350 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13522  esterase/lipase lipF  32.48 
 
 
277 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.44 
 
 
369 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11094  lipase lipU  33.33 
 
 
358 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0313121  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.37 
 
 
293 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.6 
 
 
296 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  33.19 
 
 
308 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  34.63 
 
 
309 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.57 
 
 
305 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.2 
 
 
417 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.25 
 
 
323 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.78 
 
 
325 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.78 
 
 
298 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  33.82 
 
 
816 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4410  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.83 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.46 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.61 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  32.5 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.52 
 
 
297 aa  96.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.65 
 
 
320 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.65 
 
 
320 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.7 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
303 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.53 
 
 
303 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2588  putative esterase/lipase  32.29 
 
 
298 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.86 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4007  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.72 
 
 
306 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  32.14 
 
 
303 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>