More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4410 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4410  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
323 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3769  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.45 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1272  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.94 
 
 
318 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.55 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.55 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.55 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.67 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.78 
 
 
323 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.21 
 
 
299 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.04 
 
 
309 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.39 
 
 
335 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.16 
 
 
320 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2042  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.04 
 
 
356 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  35.19 
 
 
326 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4675  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.86 
 
 
356 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4381  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.89 
 
 
350 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4150  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.89 
 
 
350 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4225  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.89 
 
 
350 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604288  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.83 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.4 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13522  esterase/lipase lipF  33.6 
 
 
277 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.09 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.86 
 
 
347 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.86 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.5 
 
 
347 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.61 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  34.6 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3818  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.65 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.16 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.48 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.7 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  32.96 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.07 
 
 
306 aa  89  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.12 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11094  lipase lipU  30.16 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0313121  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.9 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  31.54 
 
 
816 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.03 
 
 
287 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.84 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.59 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1524  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0260  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.84 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.59 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.85 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12410  acetyl hydrolase mbtJ  29.69 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.492248  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.74 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.63 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.09 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.84 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.15 
 
 
816 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.45 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.38 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.69 
 
 
816 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.68 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.38 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  30.3 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.87 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.44 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.55 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.56 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  28.25 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.7 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.38 
 
 
816 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  28.47 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.88 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.92 
 
 
818 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2588  putative esterase/lipase  33.5 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.56 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  29.96 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.87 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.94 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.67 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6169  putative lipolytic enzyme  32.14 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  31.97 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0616  esterase, putative  26.87 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.81 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.02 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.19 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  24.51 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.96 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.65 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2374  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.65 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.29 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1841  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.74 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.96 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  33.05 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.38 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  25.26 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0489  Alpha/beta hydrolase  28.91 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.95 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.05 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.75 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.49 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  26.77 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1338  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.67 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1941  esterase, putative  25.93 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.27 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>