More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4178 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  95.82 
 
 
304 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  85.99 
 
 
314 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.97 
 
 
303 aa  325  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.47 
 
 
312 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.29 
 
 
300 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.14 
 
 
303 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.86 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.57 
 
 
305 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.85 
 
 
299 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.4 
 
 
310 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.78 
 
 
320 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.63 
 
 
318 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.86 
 
 
316 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.22 
 
 
322 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  42.86 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.78 
 
 
320 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  47.15 
 
 
321 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  48.78 
 
 
320 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  46.75 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  46.75 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  46.75 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  46.75 
 
 
321 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  46.75 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  46.75 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  38.95 
 
 
335 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  48.78 
 
 
320 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.78 
 
 
320 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  44.72 
 
 
317 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.37 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  42.47 
 
 
321 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.61 
 
 
296 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  45.75 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.77 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.7 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.89 
 
 
298 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37 
 
 
301 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.78 
 
 
320 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.11 
 
 
306 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
320 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.66 
 
 
347 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.59 
 
 
325 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.59 
 
 
298 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.14 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.08 
 
 
296 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.97 
 
 
323 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.59 
 
 
318 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.59 
 
 
318 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.22 
 
 
320 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.59 
 
 
318 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.39 
 
 
354 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  43.24 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.86 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.93 
 
 
347 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.84 
 
 
277 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.11 
 
 
296 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.26 
 
 
300 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  39.11 
 
 
306 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.08 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.03 
 
 
296 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.84 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  40.64 
 
 
297 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.96 
 
 
272 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.48 
 
 
317 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 
309 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  40.35 
 
 
303 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.12 
 
 
341 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.75 
 
 
358 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  40.7 
 
 
309 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2588  putative esterase/lipase  41.43 
 
 
298 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  33.45 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.71 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.86 
 
 
300 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.97 
 
 
417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.25 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.88 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0616  esterase, putative  39.82 
 
 
303 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.64 
 
 
303 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.2 
 
 
361 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.19 
 
 
303 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.19 
 
 
303 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.19 
 
 
303 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  35.23 
 
 
561 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.19 
 
 
328 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  35.23 
 
 
326 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0843  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.35 
 
 
370 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.6 
 
 
297 aa  122  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.07 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.81 
 
 
303 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12410  acetyl hydrolase mbtJ  35.22 
 
 
306 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.492248  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.15 
 
 
298 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1026  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.08 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  31.21 
 
 
304 aa  119  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.49 
 
 
326 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.34 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.34 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.86 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.93 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.74 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4007  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.08 
 
 
306 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>