More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0126 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.14 
 
 
303 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  58.6 
 
 
300 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  54.95 
 
 
304 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.47 
 
 
311 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.97 
 
 
314 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.12 
 
 
302 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.15 
 
 
303 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54 
 
 
305 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.79 
 
 
310 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.28 
 
 
318 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.22 
 
 
320 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.63 
 
 
299 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.88 
 
 
316 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  41.78 
 
 
318 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.3 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  39.37 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  45.68 
 
 
299 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  42.11 
 
 
321 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  42.11 
 
 
321 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  42.11 
 
 
321 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  42.11 
 
 
321 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.55 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.88 
 
 
320 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.15 
 
 
298 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  44.88 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.88 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  42.42 
 
 
315 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  42.42 
 
 
315 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  42.42 
 
 
315 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.96 
 
 
297 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  44.55 
 
 
320 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.74 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  38.02 
 
 
306 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  43.75 
 
 
321 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.69 
 
 
277 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.52 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  39.93 
 
 
335 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.2 
 
 
323 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.27 
 
 
296 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.91 
 
 
309 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.68 
 
 
301 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  46 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  42.35 
 
 
321 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.69 
 
 
272 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.04 
 
 
347 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.95 
 
 
300 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.3 
 
 
296 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.13 
 
 
287 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.16 
 
 
296 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  38.4 
 
 
308 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.45 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.97 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.84 
 
 
354 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.3 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.29 
 
 
293 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.33 
 
 
296 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.82 
 
 
347 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.61 
 
 
300 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.63 
 
 
297 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.68 
 
 
317 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.53 
 
 
325 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.89 
 
 
320 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.89 
 
 
320 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.53 
 
 
298 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  36.36 
 
 
297 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.48 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.16 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2666  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.99 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.55 
 
 
319 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.45 
 
 
349 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  37.93 
 
 
303 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.14 
 
 
358 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  36.02 
 
 
561 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  39.18 
 
 
816 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  34.44 
 
 
326 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2588  putative esterase/lipase  36.36 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.25 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.59 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.29 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0843  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.86 
 
 
370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.62 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.03 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.08 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0451  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.1 
 
 
298 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.39 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1026  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.45 
 
 
423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.94 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  30.86 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.6 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.86 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.94 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.25 
 
 
297 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 
303 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.45 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.39 
 
 
303 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4850  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.86 
 
 
300 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.873673  hitchhiker  0.0000523573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>