More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0315 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
323 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  95.67 
 
 
323 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  79.01 
 
 
317 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.32 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  50.81 
 
 
318 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  53.72 
 
 
306 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  51.42 
 
 
321 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  51.42 
 
 
321 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  51.42 
 
 
321 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  51.42 
 
 
321 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.21 
 
 
322 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.53 
 
 
316 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  51.47 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  51.47 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  51.47 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  49.05 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.1 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  51.74 
 
 
321 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.42 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  49.05 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.05 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.73 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.48 
 
 
302 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.01 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.72 
 
 
305 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.84 
 
 
296 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.2 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.98 
 
 
298 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.79 
 
 
303 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  50 
 
 
299 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.16 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.94 
 
 
296 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.59 
 
 
297 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.35 
 
 
347 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.47 
 
 
297 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.15 
 
 
296 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.21 
 
 
299 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44 
 
 
304 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.55 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.23 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.14 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.3 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04570  conserved hypothetical protein  40.28 
 
 
746 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.17 
 
 
314 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.67 
 
 
306 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.86 
 
 
296 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.55 
 
 
293 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.86 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.73 
 
 
300 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.27 
 
 
321 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.04 
 
 
287 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  40.12 
 
 
326 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  40.4 
 
 
335 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  45.13 
 
 
309 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.12 
 
 
358 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.11 
 
 
335 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.83 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.26 
 
 
303 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.34 
 
 
308 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.74 
 
 
277 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  41.03 
 
 
303 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.99 
 
 
341 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.65 
 
 
325 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.65 
 
 
298 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  35.86 
 
 
561 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.55 
 
 
354 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  42.67 
 
 
816 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.8 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.21 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.9 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.9 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.9 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  35.84 
 
 
308 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.08 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.08 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.88 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.53 
 
 
816 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4007  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.94 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.53 
 
 
816 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.74 
 
 
319 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0451  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.83 
 
 
298 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.51 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  35.93 
 
 
297 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.51 
 
 
303 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  31.05 
 
 
304 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.98 
 
 
417 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.51 
 
 
303 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.43 
 
 
349 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
297 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.39 
 
 
320 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.39 
 
 
320 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.45 
 
 
352 aa  122  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.48 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.67 
 
 
816 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.02 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.65 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.65 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.06 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>