More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5336 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  89.22 
 
 
816 aa  1424    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  97.56 
 
 
818 aa  1526    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  89.71 
 
 
816 aa  1456    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
816 aa  1635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  89.22 
 
 
816 aa  1422    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  58.28 
 
 
491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.46 
 
 
484 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  54.56 
 
 
491 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  53.75 
 
 
525 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  52.92 
 
 
526 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  50.89 
 
 
531 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  53.12 
 
 
526 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  53.12 
 
 
526 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  51.4 
 
 
526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  51.31 
 
 
533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  52.08 
 
 
529 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  52.08 
 
 
529 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  52.08 
 
 
524 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  52.71 
 
 
529 aa  515  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  52.08 
 
 
524 aa  515  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  54.26 
 
 
496 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  53.25 
 
 
524 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  53.57 
 
 
529 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  52.08 
 
 
529 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  51.88 
 
 
529 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  51.2 
 
 
540 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  51 
 
 
548 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  53.35 
 
 
496 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  52.5 
 
 
496 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  49.29 
 
 
527 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.28 
 
 
493 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  51.15 
 
 
499 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.05 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  51.8 
 
 
505 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  54.06 
 
 
487 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.37 
 
 
485 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  49.28 
 
 
525 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  50.74 
 
 
493 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  52.73 
 
 
484 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  50.21 
 
 
489 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  48.43 
 
 
514 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  47.77 
 
 
527 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  45.53 
 
 
517 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  46.14 
 
 
514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  47.31 
 
 
524 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  49.37 
 
 
487 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4605  FAD dependent oxidoreductase  49.49 
 
 
529 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  48.64 
 
 
512 aa  445  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  46.93 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  47.91 
 
 
479 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.22 
 
 
488 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  47.13 
 
 
503 aa  439  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  48.73 
 
 
529 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1698  putative monooxygenase  50.66 
 
 
508 aa  435  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.647654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  46.3 
 
 
499 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  41.1 
 
 
493 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3201  flavoprotein involved in K+ transport-like  46.7 
 
 
509 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477657  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  47.65 
 
 
490 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  44.71 
 
 
513 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
520 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  42.98 
 
 
556 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.57 
 
 
493 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  46.95 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  45.36 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  45.36 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  45.71 
 
 
524 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  45.24 
 
 
506 aa  415  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  45.36 
 
 
491 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  45.28 
 
 
508 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  44.49 
 
 
487 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  44.49 
 
 
487 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  44.9 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.74 
 
 
504 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  42.92 
 
 
484 aa  386  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  42.24 
 
 
565 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  40.97 
 
 
570 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  40.62 
 
 
490 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  39.74 
 
 
488 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  41.74 
 
 
483 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  43.45 
 
 
464 aa  376  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.42 
 
 
505 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  42.18 
 
 
505 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 
484 aa  369  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2007  cyclohexanone monooxygenase  40.41 
 
 
509 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.128003  normal  0.609973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3257  putative monooxygenase  39.96 
 
 
497 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3195  putative monooxygenase  39.96 
 
 
497 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3204  putative monooxygenase  39.96 
 
 
495 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2070  cyclohexanone monooxygenase  40.41 
 
 
509 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2024  cyclohexanone monooxygenase  40.41 
 
 
509 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2243  cyclohexanone monooxygenase  39.51 
 
 
507 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4103  cyclohexanone monooxygenase  38.78 
 
 
502 aa  360  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
494 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1205  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  44.44 
 
 
505 aa  352  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3628  FAD dependent oxidoreductase  46.12 
 
 
487 aa  352  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0678388  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  40.31 
 
 
509 aa  346  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  38.42 
 
 
529 aa  346  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.02 
 
 
529 aa  341  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.96 
 
 
495 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  38.32 
 
 
491 aa  331  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  37.96 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>