More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4177 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  87.47 
 
 
490 aa  858    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  97.61 
 
 
503 aa  983    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  100 
 
 
503 aa  1004    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.13 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  54.15 
 
 
499 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.52 
 
 
506 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 
525 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  47.93 
 
 
540 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.97 
 
 
485 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  47.75 
 
 
548 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  47.22 
 
 
496 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  48.14 
 
 
524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  47.12 
 
 
526 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  47.12 
 
 
526 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  46.91 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  47.03 
 
 
529 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  51.14 
 
 
491 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  46.71 
 
 
526 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.9 
 
 
484 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  46.71 
 
 
529 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  49.16 
 
 
487 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  46.09 
 
 
524 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  45.77 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  45.57 
 
 
529 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  45.57 
 
 
529 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  46.84 
 
 
520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  51.03 
 
 
491 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.09 
 
 
493 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  45.57 
 
 
524 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  45.57 
 
 
529 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  46.46 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  51.82 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  46.93 
 
 
816 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  42.15 
 
 
527 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  48.16 
 
 
517 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  47.4 
 
 
514 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  46.69 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.13 
 
 
816 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.13 
 
 
818 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  45.66 
 
 
531 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  47.31 
 
 
527 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.94 
 
 
816 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
533 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.94 
 
 
816 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  45.55 
 
 
496 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 
493 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.33 
 
 
493 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 
493 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  45.13 
 
 
524 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  46.03 
 
 
525 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  47.35 
 
 
499 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  45.51 
 
 
493 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  45.16 
 
 
529 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  41.96 
 
 
513 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1698  putative monooxygenase  45.04 
 
 
508 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.647654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  47.54 
 
 
505 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  43.42 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  43.18 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4605  FAD dependent oxidoreductase  44.4 
 
 
529 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  42.41 
 
 
491 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
556 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  42.36 
 
 
506 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  44.59 
 
 
508 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  44.24 
 
 
479 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  42.46 
 
 
494 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 
483 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
487 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3628  FAD dependent oxidoreductase  48.61 
 
 
487 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0678388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3201  flavoprotein involved in K+ transport-like  44.2 
 
 
509 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477657  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.36 
 
 
505 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  38.07 
 
 
493 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  38.83 
 
 
514 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  46.33 
 
 
484 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1205  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  44.8 
 
 
505 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  38.88 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3257  putative monooxygenase  41.51 
 
 
497 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3204  putative monooxygenase  41.51 
 
 
495 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3195  putative monooxygenase  41.51 
 
 
497 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  38.33 
 
 
488 aa  349  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  41.15 
 
 
491 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  43.53 
 
 
492 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  41.79 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  41.79 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.79 
 
 
529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  37.47 
 
 
565 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  37.99 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2007  cyclohexanone monooxygenase  40.13 
 
 
509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.128003  normal  0.609973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2024  cyclohexanone monooxygenase  40.13 
 
 
509 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2070  cyclohexanone monooxygenase  40.13 
 
 
509 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
484 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4103  cyclohexanone monooxygenase  39.26 
 
 
502 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  40.78 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  36.72 
 
 
570 aa  327  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2243  cyclohexanone monooxygenase  38.64 
 
 
507 aa  325  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.58 
 
 
504 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  36.92 
 
 
529 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  36.25 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  36.25 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  36.25 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>