More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3012 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  66.87 
 
 
529 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  67.72 
 
 
525 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  67 
 
 
533 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  100 
 
 
540 aa  1117    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  66.87 
 
 
524 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  67.52 
 
 
529 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  66.8 
 
 
524 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  63.5 
 
 
531 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  66.87 
 
 
529 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  68.32 
 
 
526 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  68.5 
 
 
524 aa  756    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  69.31 
 
 
526 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  66.87 
 
 
529 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  69.11 
 
 
526 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  68.32 
 
 
529 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  69.31 
 
 
526 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  97.96 
 
 
548 aa  1089    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  66.87 
 
 
529 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  57.39 
 
 
527 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  56.14 
 
 
514 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  54.46 
 
 
527 aa  591  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  55.12 
 
 
517 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.04 
 
 
506 aa  557  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.25 
 
 
505 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  53.31 
 
 
496 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  54.51 
 
 
496 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  52.27 
 
 
496 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.47 
 
 
485 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  50.38 
 
 
520 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  51.86 
 
 
512 aa  527  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  53.23 
 
 
487 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  52.07 
 
 
489 aa  511  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.3 
 
 
818 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.2 
 
 
816 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.88 
 
 
493 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  51.85 
 
 
491 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1698  putative monooxygenase  51.9 
 
 
508 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.647654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  49.43 
 
 
816 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  51.67 
 
 
493 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  51.67 
 
 
493 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  51.61 
 
 
529 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  50.53 
 
 
493 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  48.69 
 
 
499 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  50.21 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.3 
 
 
816 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.1 
 
 
816 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  48.58 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.31 
 
 
484 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  50.31 
 
 
524 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  47.5 
 
 
524 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  48.55 
 
 
503 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  47.93 
 
 
503 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.25 
 
 
493 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  47.61 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  50 
 
 
499 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  46.5 
 
 
508 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  46.4 
 
 
506 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.74 
 
 
488 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  46.79 
 
 
506 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  43.78 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 
556 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  46.22 
 
 
525 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  43.87 
 
 
491 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 
484 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 
483 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  42.86 
 
 
493 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  43.96 
 
 
479 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  42.05 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4605  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3201  flavoprotein involved in K+ transport-like  44.05 
 
 
509 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477657  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3257  putative monooxygenase  40.34 
 
 
497 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852891  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.97 
 
 
505 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3195  putative monooxygenase  40.34 
 
 
497 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 
487 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3204  putative monooxygenase  40.34 
 
 
495 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  38.57 
 
 
505 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  42.37 
 
 
487 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  42.37 
 
 
487 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  42.56 
 
 
492 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.97 
 
 
529 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  39.21 
 
 
490 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  40.32 
 
 
565 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1205  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  39.67 
 
 
505 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3628  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 
487 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0678388  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  41.48 
 
 
464 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4103  cyclohexanone monooxygenase  37.5 
 
 
502 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  39.05 
 
 
529 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2243  cyclohexanone monooxygenase  38.16 
 
 
507 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2070  cyclohexanone monooxygenase  38.23 
 
 
509 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2024  cyclohexanone monooxygenase  38.23 
 
 
509 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2007  cyclohexanone monooxygenase  37.73 
 
 
509 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.128003  normal  0.609973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  35.97 
 
 
488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  37.6 
 
 
570 aa  336  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  37.8 
 
 
491 aa  336  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
504 aa  333  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
484 aa  333  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.2 
 
 
495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  37.3 
 
 
505 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>