More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1890 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  67.01 
 
 
491 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  100 
 
 
491 aa  1016    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.39 
 
 
484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  54.15 
 
 
816 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.15 
 
 
816 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.56 
 
 
816 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.07 
 
 
816 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.79 
 
 
818 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  51.98 
 
 
499 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54 
 
 
493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  52.5 
 
 
496 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  51.81 
 
 
487 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  50.21 
 
 
540 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  50.21 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  51.39 
 
 
496 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  50.52 
 
 
524 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  48.85 
 
 
529 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  48.44 
 
 
526 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  50 
 
 
496 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  48.86 
 
 
529 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  48.85 
 
 
524 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
525 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  48.64 
 
 
526 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  48.44 
 
 
526 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  48.44 
 
 
526 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  48.43 
 
 
529 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  48.22 
 
 
529 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  48.22 
 
 
524 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  48.22 
 
 
529 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  48.22 
 
 
529 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  49.06 
 
 
525 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 
506 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  50 
 
 
517 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  49.37 
 
 
527 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  49.16 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  51.31 
 
 
489 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  47.02 
 
 
531 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  46.42 
 
 
505 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  44.25 
 
 
527 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  51.14 
 
 
503 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  47.17 
 
 
533 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  47.03 
 
 
524 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  49.46 
 
 
493 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  50.52 
 
 
503 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  45.09 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  43.09 
 
 
514 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.72 
 
 
485 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  46.95 
 
 
479 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  48.18 
 
 
484 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  47.44 
 
 
520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  47.92 
 
 
492 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  47.5 
 
 
512 aa  443  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  47.1 
 
 
499 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4605  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 
529 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  49.68 
 
 
490 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1698  putative monooxygenase  48.27 
 
 
508 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.647654  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3201  flavoprotein involved in K+ transport-like  45.89 
 
 
509 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477657  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  45.55 
 
 
487 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  43.85 
 
 
491 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.41 
 
 
488 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  43.99 
 
 
508 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  45.32 
 
 
529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  41.44 
 
 
513 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  43.04 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  43.04 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  40.21 
 
 
556 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  42.46 
 
 
483 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  43.79 
 
 
464 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  42.08 
 
 
505 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.32 
 
 
504 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  41.91 
 
 
524 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  40.29 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.6 
 
 
505 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3204  putative monooxygenase  39.66 
 
 
495 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3257  putative monooxygenase  39.66 
 
 
497 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852891  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  41.26 
 
 
506 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3195  putative monooxygenase  39.66 
 
 
497 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3628  FAD dependent oxidoreductase  44.69 
 
 
487 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0678388  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 
494 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4103  cyclohexanone monooxygenase  39.22 
 
 
502 aa  356  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  40.41 
 
 
506 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2243  cyclohexanone monooxygenase  38.74 
 
 
507 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  36.98 
 
 
490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.72 
 
 
529 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2024  cyclohexanone monooxygenase  38.78 
 
 
509 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2070  cyclohexanone monooxygenase  38.78 
 
 
509 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  36.99 
 
 
565 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1368  flavin-containing monooxygenase FMO  43.3 
 
 
397 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2007  cyclohexanone monooxygenase  38.34 
 
 
509 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.128003  normal  0.609973 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  38.35 
 
 
570 aa  343  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1205  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  40.91 
 
 
505 aa  335  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  35.09 
 
 
488 aa  332  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
484 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.08 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  37.45 
 
 
529 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2784  hypothetical protein  37.97 
 
 
641 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  37.15 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>