More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2185 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  624  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4504  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.27 
 
 
303 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0564939  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6421  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  58.92 
 
 
303 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19712  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5077  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.49 
 
 
292 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0300585  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  45.24 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1826  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.31 
 
 
315 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0590291  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2246  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.99 
 
 
312 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3282  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.93 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0615  lipolytic protein  41.53 
 
 
318 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3965  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.78 
 
 
309 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0592  putative lipase/esterase  39.58 
 
 
322 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  37.91 
 
 
309 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0824  putative lipase (esterase)  36.84 
 
 
319 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.529506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5236  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.4 
 
 
318 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3592  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.26 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4506  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3319  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.4 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.571151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5048  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.4 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4976  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.09 
 
 
318 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  40.07 
 
 
331 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.56 
 
 
318 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6169  putative lipolytic enzyme  39.72 
 
 
331 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4456  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.36 
 
 
318 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.82 
 
 
310 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.72 
 
 
312 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  39.42 
 
 
312 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.42 
 
 
311 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.81 
 
 
314 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  35.34 
 
 
314 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  42.02 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.3 
 
 
314 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.41 
 
 
311 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.41 
 
 
320 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1955  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.8 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0494  putative lipase  38.8 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2132  lipase (esterase)  38.8 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.94 
 
 
313 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.8 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0983  putative lipase  38.8 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.62 
 
 
370 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.82 
 
 
317 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.22 
 
 
319 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.87 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.33 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0764  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.8 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  36.49 
 
 
317 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  40.43 
 
 
316 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  37.16 
 
 
346 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.26 
 
 
317 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.15 
 
 
376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1845  lipase, putative  38.59 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.17 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.01 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.5 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.65 
 
 
371 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.33 
 
 
371 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.17 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  41.05 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  39.06 
 
 
320 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.17 
 
 
311 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.24 
 
 
323 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  39.76 
 
 
328 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.4 
 
 
335 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.43 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.74 
 
 
316 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.15 
 
 
307 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.86 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.83 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.02 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.66 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.02 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.92 
 
 
317 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  37.85 
 
 
319 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0292  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.26 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0387  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.34 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.67 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.95 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.71 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.98 
 
 
310 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.4 
 
 
628 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0301  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.81 
 
 
316 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0311  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.81 
 
 
316 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.207526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  35.44 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.11 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.11 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.11 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.04 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.92 
 
 
309 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.28 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.44 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.09 
 
 
315 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  39.01 
 
 
312 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.77 
 
 
313 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.78 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  35.62 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.11 
 
 
307 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>