More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3541 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.13 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.51 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.13 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.63 
 
 		 329 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0941  putative lipase  44.69 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0525  putative lipase  42.95 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.42 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.89 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.98 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  41.15 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.68 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.59 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  38.12 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.29 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.6 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.64 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.92 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.66 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  34.88 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.1 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  36.18 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.59 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.7 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.27 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.17 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.43 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.66 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.95 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  35.32 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.08 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.29 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.87 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  35.98 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.9 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.46 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.31 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.31 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.66 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.51 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.25 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  34.83 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.17 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.11 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  38.62 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.32 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.68 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.21 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.71 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.21 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.07 
 
 		 375 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.62 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  36.97 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.49 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.82 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.55 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  35.74 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  31.93 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  33.6 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.45 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  37.61 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  37.61 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  37.61 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  37.61 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.31 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  37.61 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.58 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  36.51 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  37.39 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.74 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.43 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.4 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.44 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  37.18 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  33.33 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  31.96 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.5 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.18 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.99 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  37.66 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0292  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.69 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.57 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.15 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  33.11 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.9 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.4 
 
 		 628 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>