More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0525 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0525  putative lipase  100 
 
 		 318 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  73.44 
 
 		 329 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  74.06 
 
 		 329 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  72.81 
 
 		 329 aa  487  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  65.16 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0941  putative lipase  51.09 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  42.95 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  39.84 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.44 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.13 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.33 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.21 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.05 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.93 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.67 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.17 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.41 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.97 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.22 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  39.04 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.76 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  36.48 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.6 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.07 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.45 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.16 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  35.04 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  35.93 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.7 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  35.83 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.66 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  35.92 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  35.92 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  35.94 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  35.79 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  35.92 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.68 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  35.92 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  35.92 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  35.34 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  38.8 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.04 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.19 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.2 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  36.75 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.68 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.68 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.67 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.82 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  34.63 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.24 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.21 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  35.56 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.78 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.14 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  40.25 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.44 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.33 
 
 		 371 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  34.49 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.77 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.16 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.8 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  36.36 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  38.46 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.73 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.33 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.99 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.72 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.55 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.83 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.44 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.86 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.8 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  38.46 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  35.79 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  35.39 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  38.08 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.16 
 
 		 628 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.44 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.13 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  34.85 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.51 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  37.66 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.38 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.6 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.71 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.6 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.17 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.9 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  32.47 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  32.47 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2863  esterase/lipase/thioesterase  35.22 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>