More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0941 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0941  putative lipase  100 
 
 
327 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  57.5 
 
 
310 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.89 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.4 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.09 
 
 
329 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0525  putative lipase  51.09 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  44.69 
 
 
310 aa  270  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.81 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.03 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.64 
 
 
318 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.4 
 
 
311 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.71 
 
 
311 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  32.79 
 
 
321 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.25 
 
 
317 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.23 
 
 
311 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.97 
 
 
314 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  30.97 
 
 
314 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  30.99 
 
 
318 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.32 
 
 
328 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  31.64 
 
 
311 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  35.18 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.56 
 
 
313 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  34.55 
 
 
316 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
308 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.96 
 
 
312 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.71 
 
 
314 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  30.74 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  31.23 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.59 
 
 
316 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  31.77 
 
 
320 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.07 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.68 
 
 
313 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.67 
 
 
317 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.2 
 
 
311 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.31 
 
 
352 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.18 
 
 
292 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
313 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 
310 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.66 
 
 
310 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.21 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  30.96 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.07 
 
 
312 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.24 
 
 
376 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  31.82 
 
 
321 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0292  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.03 
 
 
316 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.5 
 
 
370 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.74 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.12 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.29 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  31.12 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  31.79 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.7 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.85 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0301  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.03 
 
 
316 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0311  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.03 
 
 
316 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.207526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.77 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.91 
 
 
316 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.47 
 
 
310 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
310 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  31.3 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.8 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.97 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.65 
 
 
304 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.77 
 
 
311 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.48 
 
 
371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.84 
 
 
317 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.72 
 
 
308 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.06 
 
 
325 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.67 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.74 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.7 
 
 
309 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2863  esterase/lipase/thioesterase  30.88 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3916  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.08 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.45 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.25 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.08 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.96 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  31.68 
 
 
292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  31.91 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.12 
 
 
315 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 
312 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.49 
 
 
320 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.33 
 
 
326 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.18 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  32.23 
 
 
444 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.33 
 
 
323 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.79 
 
 
311 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  32.54 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4004  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.48 
 
 
300 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199981  hitchhiker  0.0000000000792158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.04 
 
 
316 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.04 
 
 
321 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.36 
 
 
329 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.68 
 
 
319 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  30.1 
 
 
323 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.88 
 
 
309 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>