More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3916 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3916  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.49 
 
 
315 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1756  lipolytic enzyme  43.85 
 
 
318 aa  259  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.39 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.06 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.34 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.54 
 
 
316 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  35.57 
 
 
314 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.43 
 
 
312 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  40.14 
 
 
320 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.78 
 
 
319 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.24 
 
 
314 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  36.67 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  36.67 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  36.67 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  36.67 
 
 
352 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.64 
 
 
301 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  36.33 
 
 
319 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1799  putative esterase/lipase  35.81 
 
 
320 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  40.15 
 
 
316 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.36 
 
 
307 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  36 
 
 
327 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.71 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.11 
 
 
317 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.35 
 
 
344 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.08 
 
 
326 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  35.02 
 
 
383 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.85 
 
 
310 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.68 
 
 
311 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  33.55 
 
 
344 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  40.59 
 
 
312 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.67 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  39.83 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
310 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.67 
 
 
352 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  34.92 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
320 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.01 
 
 
349 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.41 
 
 
321 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.4 
 
 
310 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.4 
 
 
310 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.94 
 
 
311 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.11 
 
 
338 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.58 
 
 
313 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.11 
 
 
338 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2383  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.06 
 
 
327 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.8 
 
 
326 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.65 
 
 
319 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.12 
 
 
321 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.28 
 
 
375 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  37.74 
 
 
444 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.11 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.59 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.11 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.55 
 
 
309 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.79 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.84 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  33.44 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  33.11 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  33.78 
 
 
321 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.88 
 
 
359 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.59 
 
 
375 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.97 
 
 
315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.59 
 
 
375 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.54 
 
 
376 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.76 
 
 
311 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.22 
 
 
307 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
319 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.25 
 
 
356 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  34.39 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.54 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  37.96 
 
 
346 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.97 
 
 
309 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.38 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268588  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  33.95 
 
 
318 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.03 
 
 
324 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.78 
 
 
371 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  34.5 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.25 
 
 
289 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.68 
 
 
320 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.2 
 
 
323 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.3 
 
 
313 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.68 
 
 
309 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.37 
 
 
325 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.37 
 
 
371 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32 
 
 
312 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  33.65 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.67 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.08 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
312 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.24 
 
 
329 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  37.5 
 
 
376 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  38.36 
 
 
321 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.19 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>