More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4004 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4004  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199981  hitchhiker  0.0000000000792158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.46 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.04 
 
 
315 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.88 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  35.95 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.93 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.35 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.71 
 
 
317 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.71 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.15 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.15 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.52 
 
 
313 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.2 
 
 
340 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.61 
 
 
313 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.04 
 
 
310 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0941  putative lipase  30.19 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  33.45 
 
 
884 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  32.27 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.97 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.77 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.51 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.5 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  31.14 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.82 
 
 
375 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.82 
 
 
375 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  33.78 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  34.26 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.23 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.71 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.94 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.19 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  33.78 
 
 
309 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.52 
 
 
382 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.92 
 
 
308 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1361  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.48 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.72 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.01 
 
 
328 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.24 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.56 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.28 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.94 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3167  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.44 
 
 
310 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
307 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.8 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2863  esterase/lipase/thioesterase  30.97 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.03 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.28 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.08 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.6 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.73 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  33.64 
 
 
346 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.98 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.97 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  30.35 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  32.11 
 
 
444 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.61 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.27 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  29.84 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3543  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.54 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.560296  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.76 
 
 
310 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  30.55 
 
 
311 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3316  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.62 
 
 
304 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0637  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.62 
 
 
304 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.08 
 
 
329 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  30.4 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.7 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  29.15 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.17 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  30.4 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.34 
 
 
352 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  30.86 
 
 
329 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.05 
 
 
313 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.82 
 
 
338 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  32.93 
 
 
376 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.19 
 
 
323 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  30.43 
 
 
365 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
308 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.46 
 
 
300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.78 
 
 
314 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.89 
 
 
344 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.46 
 
 
300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5138  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.77 
 
 
286 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.46 
 
 
300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3428  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.11 
 
 
322 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.04 
 
 
311 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3590  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.63 
 
 
305 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3430  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.64 
 
 
297 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0801  hypothetical protein  30.23 
 
 
304 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.56 
 
 
355 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.95 
 
 
316 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.19 
 
 
312 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.44 
 
 
337 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.18 
 
 
316 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 
279 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  30.92 
 
 
310 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  29.44 
 
 
337 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.63 
 
 
325 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  31.62 
 
 
319 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>