More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5077 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_5077  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0300585  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1826  Alpha/beta hydrolase fold-3  48.12 
 
 
315 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0590291  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.49 
 
 
312 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4504  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.15 
 
 
303 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0564939  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6421  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.28 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19712  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2246  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.56 
 
 
312 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0592  putative lipase/esterase  43.88 
 
 
322 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  46.13 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0615  lipolytic protein  39.47 
 
 
318 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5236  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.19 
 
 
318 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0983  putative lipase  36.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0494  putative lipase  36.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2132  lipase (esterase)  36.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1955  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3319  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.03 
 
 
318 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.571151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5048  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.03 
 
 
318 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  43.86 
 
 
331 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0764  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.45 
 
 
319 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3965  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3592  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.45 
 
 
319 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6169  putative lipolytic enzyme  43.16 
 
 
331 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3282  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.15 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4456  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.1 
 
 
318 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477354  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4976  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.83 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0824  putative lipase (esterase)  36.79 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.529506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1460  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.25 
 
 
308 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  37.54 
 
 
320 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  42.8 
 
 
311 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.41 
 
 
310 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1845  lipase, putative  36.42 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.32 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  37.64 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.85 
 
 
311 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.27 
 
 
313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.78 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.28 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.74 
 
 
313 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.26 
 
 
314 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.82 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.62 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.86 
 
 
359 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.93 
 
 
310 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.87 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.07 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.99 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.07 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.65 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.37 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.41 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  40.08 
 
 
305 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  37.59 
 
 
309 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.4 
 
 
320 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.42 
 
 
370 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.19 
 
 
371 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.03 
 
 
352 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  38.79 
 
 
316 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  42.63 
 
 
320 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.31 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.92 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3188  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.64 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.42 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.56 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.56 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  38.66 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.07 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3541  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.4 
 
 
312 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
312 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3486  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.8 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0801  hypothetical protein  32.76 
 
 
304 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.3 
 
 
316 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4506  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 
321 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  38.63 
 
 
376 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.97 
 
 
301 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3590  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.1 
 
 
305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.2 
 
 
356 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.67 
 
 
317 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3657  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
305 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  38.31 
 
 
317 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.95 
 
 
324 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.67 
 
 
311 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3316  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.56 
 
 
304 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0637  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.56 
 
 
304 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144121  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.76 
 
 
316 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.56 
 
 
313 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.67 
 
 
321 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0648  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
305 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.9 
 
 
308 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  38.89 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3780  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.65 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4412  alpha/beta fold family hydrolase  31.99 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  39.25 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.2 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.39 
 
 
375 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  39.01 
 
 
328 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.56 
 
 
325 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.22 
 
 
321 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>